2015年7月国家建立“社会组织参与艾滋病防治基金”，云南省疾病预防控制中心作为云南省项目管理机构，三年来，在国家社会组织参与艾滋病防治基金管理委员会办公室和云南省防艾局的领导下，在云南省民政部门和各级艾滋病防治办公室的协调和各级疾病预防控制机构的大力支持下，管理工作获得了国家认可,主要体现在:

一是申报并参与国家项目的社会组织数位于全国前列。2015年，申报47个、中标42个，中标资金299.6万元；2016年-2017年申报84个、中标69个项目，中标资金438万元；2019-2020年申报69个，中标64个，中标资金465万。

二是社会组织的扶持和培育初显成效。截至目前,我省已有476个参与艾滋病防治的社会组织培育基地，建立了“小组挂靠培育基地”的申请机制。2018年,我省有2个社会组织成功入选实习基地，占全国总数的28.6%（2/7）。

三是项目管理网络初步形成。项目实行逐级管理,建立了全省项目管理领域专家网络及项目督导与考核机制,目前运行良好。

2018年12月18日，国家社会组织参与艾滋病防治基金管理委员会办公室发来感谢信，充分肯定了云南省国家社会组织参与艾滋病防治基金项目管理工作成效及在全国项目进展中发挥的积极作用。