为支持社会组织参与艾滋病防治工作，发挥其在艾滋病防治领域的作用，国家建立社会组织参与艾滋病防治基金。2018年7月3日，云南省防治艾滋病局根据国家申请指南，下发了《云南省防治艾滋病局关于组织开展2019-2020年国家社会组织参与艾滋病防治基金项目申报工作的通知》，正式启动我省项目申请工作。作为省级项目管理机构，省疾控中心于8月6-10日组织省级专家共计11人分组审核项目，并指导社会组织对申请书修改完善，经省疾控中心最终审核后，提交国家基金办。

国家基金办通过组织评审并进行了中标公示，云南省共组织上报项目69个，中标64个（列全国第2），总金额为465.44万元，中标率为92.8%。主要领域包括暗娼干预及动员检测（14个）、男同干预及动员检测（8个）、吸毒人群干预及动员检测（6个）、感染者和病人提供随访咨询（36个）；获得项目的13个州（市）包括德宏（13个）、红河（9个）、大理（8个）、楚雄（7个）、玉溪（4个）、保山（4个）、临沧（4个）、文山（3个）、昆明（3个）、曲靖（2个）、丽江（2个）、昭通（1个）、怒江（1个）和省级（3个）。