2006年，红河州个旧市、曲靖市罗平县分别成功获国家卫生城市和国家卫生县城称号，实现了云南省国家卫生城市、国家卫生县城零的突破。2011年昆明市寻甸县作为少数民族贫困县创建国家卫生县城成功，坚定了各州、市创建国家卫生城市、国家卫生县城（乡镇）的信心。2011年，昆明市、玉溪市、安宁市、芒市成功创建国家卫生城市，云南省也成为当年全国爱卫会命名国家卫生城市最多的省份之一。

截至2012年底，云南省已命名的国家卫生城市5个（个旧市、昆明市、玉溪市、安宁市、芒市），国家卫生县城（乡镇）8个（石林县、罗平县、嵩明县、镇沅县、安宁市温泉镇、安宁市青龙镇、安宁市八街镇、玉溪市大营街镇）。已通过国家技术评估待命名的国家卫生城市1个（蒙自市），通过国家暗访的城市2个（普洱市、开远市）。到2013年底，云南省将有昆明市寻甸县、晋宁县、宜良县、富民县、禄劝县，玉溪市易门县、新平县、澂江县，红河州建水县、泸西县、屏边县，昭通市水富县，禄劝县云龙乡、安宁市禄脿镇等14个县城（乡镇）荣获国家卫生县城（乡镇）殊荣，昆明市将实现国家卫生县城全覆盖。