地震发生后，省、州、县乡级卫生部门全力以赴投入到地震抗灾工作中。截至9月2日18时，省、州、县、乡级卫生部门累计出动车辆46辆次，其中救护车16辆次，其他应急指挥、疾病预防控制、卫生监督车辆30辆次；共有194名医务人员深入灾区进行应急救援；共发放和使用了价值37.9万元的药品，临时安置点的灾民就诊2645人次（其中德钦县1408人、香格里拉县1237人）。

地震共造成3人死亡、44人受伤，目前在香格里拉人民医院住院救治17人，其中：从四川省得荣县转入5人；危重1人、重伤6人。目前，伤员马仲海伤情仍然危重，经省、州级专家会诊抢救，失血性休克已得到暂时控制，已紧急从昆明市血液中心调配病人急需输注的血小板，积极救治患者，但仍未脱离危险；其他伤员均有所好转。

下一阶段，灾区、特别是灾民安置点的卫生防疫工作是重中之重。针对目前灾区卫生防疫人员和药品、器械不足的问题，省卫生厅派出省级医疗队伍1支9人和省级卫生防疫队伍1支7人；调拨手动喷雾器20台、电动喷雾器8台、杀虫剂280公斤、消毒灵80件支援地震灾区。灾区安置点截至目前已发放消杀药品390公斤，其中德钦县230公斤、香格里拉县160公斤。累计消杀面积104440平方米，加强灾民临时安置点的消杀工作。香格里拉县新增加灾民临时安置点17个，累计设置灾民临时安置点41个（其中香格里拉县34个、德钦县7个）。2日，抽调州、县食品药品监督管理局及州、县级卫生监督执法人员26人，加强灾民临时安置点食品安全、饮用水卫生和生活环境卫生的监督管理，加强疫情监测，防止灾后发生重大疫情，保障灾民的身体健康。

目前，灾区无重大传染病流行，抗震救灾卫生应急各项工作有序推进。